KU:s årliga granskning består av två delar. Den ena går ut på att kontrollera om ministrarna följt reglerna för regeringens arbete och på andra sätt handlat korrekt. Riksdagens ledamöter har rätt att anmäla ministrarna till KU, och den här delen av granskningen bygger på anmälningar.
Den andra delen är en allmän granskning. KU går då igenom olika handlingar från Regeringskansliet för att se om regeringen följt lagar och praxis vid handläggningen av regeringsärendena.